臺大醫院雲林分院於2014年7月成立「環境及職業醫學部」，將臺大醫院總院豐富的職業醫學專業資源與跨領域照護團隊帶入雲嘉地區，致力於提供在地勞工及職業傷病個案完善的醫療照護與健康服務。團隊由職業醫學專科醫師、個案管理師、職能治療師等專業人員組成，透過跨團隊合作，提供職業傷病預防、診斷、治療、工作能力評估、復工輔導及健康促進等整合性服務。
為回應雲嘉地區以農業為主的產業特性，並關注農業工作者長期面臨之職業健康風險，本院於2023年7月成立「農業環境與職業健康中心」，以農業工作者健康需求為核心，推動農業職業傷病預防、健康促進、教育宣導及醫療照護服務，提升農業工作者對職業傷病之認識與自我保護能力。期盼透過專業醫療服務、在地關懷與跨領域合作，打造更友善、安全且健康的工作環境，守護每一位勞動者與農業工作者的健康福祉，實踐臺大醫院雲林分院作為中臺灣健康守護者的使命。
由於農、林、漁、牧業，隨農作物(養殖)種類不同，生產週期、使用機具和農藥(化學藥劑)種類也大不相同，及戶外露天工作、短期季節性密集工作、工作時段不固定、工作場所與居家環境難以區分等，造成難以釐清「農業」工作者多元職業暴露與其所罹患疾病間之因果關係。
透過設立「農業環境與職業健康中心」進行整合診治、研究調查、預防及教育訓練體制，收集農民世代職業病暴露風險，制定早期發現策略，進而評估與反饋系統，以獲取農業工作者職業傷病問題及環境暴露危害等完整資訊。而根據這些資訊，可以按知情的優先順序執行及預防，並建立測量改善程度，作為基準。藉由預防與教育訓練之落實，降低暴露於「農民職業病」之風險，進而提高國家及地方層級之「農民職業病」預防工作，極力鼓勵採取透過預防來改善農業工作者及其家人健康與安全之行動。
