◉ 本部概況
本部位於斗六院區復健大樓一樓及虎尾院區三樓，目前設分物理治療組、職能治療組與語言治療組等三個組別，並接受行政院勞動部補助於虎尾院區設立工作強化中心，另依功能性劃分有兒童早療復健團隊、急性後期整合照護（PAC）團隊、心肺功能復健團隊、工作強化團隊及運動傷害團隊為中台灣民眾提供專業的復健醫療服務。
◉ 人員編制
工作人員方面，目前台大醫院雲林分院復健部有主治醫師專任 5 名及兼任 1 名。治療人員中，有物理治療專業人員 20 名（斗六院區 16 名、虎尾院區 4 名），職能治療專業人員 11 名（斗六院區 8 名、虎尾院區 4 名），語言治療專業人員 4 名（斗六院區 3 名、虎尾院區 1 名），心理治療專業人員 1 名，另有護理師 2 名，個案管理師 1 名，書記 4 名及研究助理 1 名，形成陣容龐大之復健醫療團隊，對各類病患提供門診與住院之各種復健醫療，包括物理治療、職能治療、語言治療、副木及鞋墊製作、輔具評估等。另有物理治療及職能治療學科系實習學生於本科部實習。
◉ 專業團隊
本部專業團隊計有：兒童早療復健團隊（林珊如醫師負責），急性後期整合照護（PAC）計畫（黃雅萍醫師負責）、心肺復健團隊（王耀緯醫師負責），工作強化團隊（陳信水醫師負責），運動傷害團隊（陳信水醫師負責）。
◉ 研習教學
除復健治療部門外，本部亦提供物理治療學科系、職能治療學科系及語言治療學科系學生臨床實習以及復健課程演講教學。
