職業災害及職業病勞工常面臨身心健康受損、工作能力下降及就醫資源不足等挑戰，尤其非都會地區勞工更容易因醫療資源分布不均而增加就醫困難。為提升雲嘉地區職業傷病勞工之醫療可近性與照護品質，臺大醫院雲林分院於2014年7月成立環境及職業醫學部暨職業傷病防治中心，將臺大醫院總院之職業醫學專業團隊與資源延伸至雲嘉地區，致力於提供完整且優質之職業傷病診治服務。
本部整合院內跨專業醫療團隊，並串聯勞政、衛政及相關外部資源，提供職業傷病之預防、診斷、治療、復健、重建、工作能力評估、復工輔導及轉介諮詢等全方位服務，建構以勞工為中心之整合照護模式。透過職業醫學專科醫師、職業衛生護理師、個案管理師，以及職能治療師、復健治療師、心理師等專業人員共同合作，協助職業傷病勞工早期診斷、早期治療及順利重返職場。
本部秉持「正直誠信、創造卓越、團隊合作、健康尊嚴、尊重關懷」之核心價值，發揮職業傷病診治醫療認可機構於區域職業健康服務網絡中的領導角色，提供職業傷病勞工及其家庭全人、全程、全方位照護，並持續推動職業傷病防治與健康促進工作，落實臺大醫院「中臺灣健康守護者」之使命。
