本院教學研究部隸屬於教學副院長督導，設置有部主任一名；研究組、研究行政組、教學組、教學行政組組長各一名；教學型主治醫師兩名、研究型主治醫師兩名；組員十名，共計十六名。 主要業務係教學資源管理、臨床師資培育、實驗技術教學、醫療研究、醫事人員教育訓練等，並有教師培育中心、教材室、統計諮詢、圖書室及第一、第二共同實驗室等空間，俾利業務之推行。
醫學研究組：運用第一共同實驗室及第二共同實驗室之資源、實驗技術教學、統計諮詢服務等業務。
研究行政組：負責研究計畫、跨院/學界合作、研究諮詢、受試者保護、學術暨研究倫理等業務。
教學組：負責指導實習生、主掌臨床教師培訓、臨床醫事人員培訓計畫、師資培育、醫學生/住院醫師訓練、二年期醫師畢業後一般醫學訓練、聯合訓練(送訓及代訓)、臨床技能中心、BLS/ALS訓練等業務。
教學行政組：負責業務為統籌教學醫院評鑑、醫學教育訓練、醫事人員(含醫師)教育訓練及進修、圖書室、教材製作等業務。
